14岁即开始用8毫米摄像机拍电影。日本大学艺术系美术学科期间，曾自组剧团，身兼编剧、导演、演员等职。毕业后，在电视广告制作公司任职四年后辞职。1985年，组建“海兽剧团”，从事戏剧演出活动，同时亦自拍摄电影。

　　1987年的8毫米影片《电线杆小子的冒险》在匹亚电影节（PFF）获得金奖。1989年，首次拍摄影院电影《铁男》（16毫米）。其超快速的画面和声音、给观众以压迫感、手法独特的电影，不仅吸引了海内外众多的影迷、评论家、也获得不少海外影像作家的好评。其独揽制作、导演、编剧、表演、摄影、灯光、剪辑、美术为一身的独立制作手法，成为日本电影界独具异彩的一枝奇葩。《铁男》也是冢本晋也最具代表性的作品。

　　作品年表：1989年《铁男》罗马国际幻想电影节金奖获奖作品，1991年《怪谈比留子》，1992年《铁男2》法国D'AVORIAZ国际幻想电影节参展作品，意大利TAORMINA国际电影节评审员特别奖，1995年《东京铁拳》圣丹斯电影节金奖，1999年《双生儿》威尼斯国际电影节正式参赛作品，多伦多国际电影节正式参赛作品。2000年后，接连推出两部黑白片《异次元杀人事件》和《六月之蛇》，受到影迷追捧。《六月之蛇》获得当年威尼斯电影节评委会特别奖，冢本也达到了事业的高峰。04年，首次邀请浅野忠信担任主角，拍摄出温柔的彩色片《死亡解剖》。之后不久，冢本受到邀请参加了“JAM FILMS”第四弹《FEMALE》的制作计划，他根据小池真理子的原作制作出短片《玉虫》，成为整部作品中最受关注的一段。完成“FEMALE”后，年过四十的冢本玩起了DV，拍摄出另类恐怖片《雾》。06年又携手松田龙平、安藤政信制作恐怖片《恶梦侦探》，并计划将其拍摄成一部系列电影，其续集的拍摄已在07年夏启动。