| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3211 | 湖州 | 06:32 | 杭州东 | 07:08 | 厦门北 | 13:07 | 厦门北 | 13:07 |
| D3122 | 杭州东 | 07:20 | 杭州东 | 07:20 | 厦门北 | 14:13 | 广州东 | 18:57 |
| D3123 | 杭州东 | 07:20 | 杭州东 | 07:20 | 厦门北 | 14:13 | 广州东 | 18:57 |
| D3238 | 南京南 | 06:11 | 杭州东 | 07:25 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D3239 | 南京南 | 06:11 | 杭州东 | 07:25 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D3111 | 杭州东 | 07:30 | 杭州东 | 07:30 | 厦门北 | 14:22 | 深圳北 | 17:54 |
| D2287 | 上海虹桥 | 06:57 | 杭州东 | 08:12 | 厦门北 | 14:53 | 深圳北 | 18:17 |
| D3307 | 杭州东 | 08:21 | 杭州东 | 08:21 | 厦门北 | 15:10 | 深圳北 | 18:32 |
| D2287 | 上海虹桥 | 06:57 | 杭州南 | 08:23 | 厦门北 | 14:53 | 深圳北 | 18:17 |
| D3131 | 上海虹桥 | 07:32 | 杭州东 | 08:37 | 厦门北 | 15:24 | 武平 | 17:29 |
| D3134 | 上海虹桥 | 07:32 | 杭州东 | 08:37 | 厦门北 | 15:24 | 武平 | 17:29 |
| D377 | 上海虹桥 | 07:41 | 杭州东 | 09:08 | 厦门北 | 15:41 | 深圳北 | 18:48 |
| D3201 | 上海虹桥 | 08:17 | 杭州东 | 09:31 | 厦门北 | 16:29 | 厦门北 | 16:29 |
| D3295 | 南京南 | 07:49 | 杭州东 | 09:39 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D3298 | 南京南 | 07:49 | 杭州东 | 09:39 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D2281 | 南京南 | 06:32 | 杭州东 | 10:13 | 厦门北 | 16:56 | 深圳北 | 20:11 |
| D2289 | 南通 | 07:30 | 杭州东 | 10:18 | 厦门北 | 17:01 | 深圳北 | 20:22 |
| D2292 | 南通 | 07:30 | 杭州东 | 10:18 | 厦门北 | 17:01 | 深圳北 | 20:22 |
| D3205 | 上海虹桥 | 09:34 | 杭州东 | 10:44 | 厦门北 | 17:24 | 厦门北 | 17:24 |
| D3107 | 上海虹桥 | 09:39 | 杭州东 | 11:21 | 厦门北 | 17:54 | 深圳北 | 21:25 |
| D3125 | 淮安东 | 06:55 | 杭州东 | 11:32 | 厦门北 | 18:07 | 深圳北 | 21:20 |
| D3165 | 杭州东 | 12:05 | 杭州东 | 12:05 | 厦门北 | 18:48 | 龙岩 | 19:58 |
| D3168 | 杭州东 | 12:05 | 杭州东 | 12:05 | 厦门北 | 18:48 | 龙岩 | 19:58 |
| D3135 | 南京南 | 08:03 | 杭州东 | 12:12 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| D3138 | 南京南 | 08:03 | 杭州东 | 12:12 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| D2283 | 南通 | 09:40 | 杭州东 | 12:23 | 厦门北 | 19:07 | 深圳北 | 22:26 |
| D2286 | 南通 | 09:40 | 杭州东 | 12:23 | 厦门北 | 19:07 | 深圳北 | 22:26 |
| D2293 | 南京南 | 10:57 | 杭州东 | 12:47 | 厦门北 | 19:20 | 深圳北 | 22:35 |
| D3291 | 上海虹桥 | 12:14 | 杭州东 | 13:18 | 厦门北 | 20:17 | 龙岩 | 21:28 |
| D3294 | 上海虹桥 | 12:14 | 杭州东 | 13:18 | 厦门北 | 20:17 | 龙岩 | 21:28 |
| D3144 | 南京南 | 11:12 | 杭州东 | 14:25 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| D3141 | 南京南 | 11:12 | 杭州东 | 14:25 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| D3233 | 杭州东 | 14:33 | 杭州东 | 14:33 | 厦门 | 22:13 | 厦门 | 22:13 |
| D3144 | 南京南 | 11:12 | 杭州南 | 14:36 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| D3141 | 南京南 | 11:12 | 杭州南 | 14:36 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| D3217 | 杭州东 | 15:59 | 杭州东 | 15:59 | 厦门北 | 22:47 | 厦门北 | 22:47 |