| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3238 | 南京南 | 06:11 | 余姚北 | 08:07 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D3239 | 南京南 | 06:11 | 余姚北 | 08:07 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D3111 | 杭州东 | 07:30 | 余姚北 | 08:18 | 厦门北 | 14:22 | 深圳北 | 17:54 |
| D3307 | 杭州东 | 08:21 | 余姚北 | 09:05 | 厦门北 | 15:10 | 深圳北 | 18:32 |
| D3131 | 上海虹桥 | 07:32 | 余姚北 | 09:19 | 厦门北 | 15:24 | 武平 | 17:29 |
| D3134 | 上海虹桥 | 07:32 | 余姚北 | 09:19 | 厦门北 | 15:24 | 武平 | 17:29 |
| D3295 | 南京南 | 07:49 | 余姚北 | 10:31 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D3298 | 南京南 | 07:49 | 余姚北 | 10:31 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D2281 | 南京南 | 06:32 | 余姚北 | 10:49 | 厦门北 | 16:56 | 深圳北 | 20:11 |
| D3205 | 上海虹桥 | 09:34 | 余姚北 | 11:30 | 厦门北 | 17:24 | 厦门北 | 17:24 |
| D3125 | 淮安东 | 06:55 | 余姚北 | 12:09 | 厦门北 | 18:07 | 深圳北 | 21:20 |
| D3135 | 南京南 | 08:03 | 余姚北 | 12:58 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| D3138 | 南京南 | 08:03 | 余姚北 | 12:58 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| D2293 | 南京南 | 10:57 | 余姚北 | 13:33 | 厦门北 | 19:20 | 深圳北 | 22:35 |
| D3291 | 上海虹桥 | 12:14 | 余姚北 | 14:03 | 厦门北 | 20:17 | 龙岩 | 21:28 |
| D3294 | 上海虹桥 | 12:14 | 余姚北 | 14:03 | 厦门北 | 20:17 | 龙岩 | 21:28 |
| D3233 | 杭州东 | 14:33 | 余姚北 | 15:19 | 厦门 | 22:13 | 厦门 | 22:13 |
| D3217 | 杭州东 | 15:59 | 余姚北 | 16:46 | 厦门北 | 22:47 | 厦门北 | 22:47 |