| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3135 | 南京南 | 08:03 | 南京南 | 08:03 | 丹阳 | 08:49 | 赣州 | 22:53 |
| D3138 | 南京南 | 08:03 | 南京南 | 08:03 | 丹阳 | 08:49 | 赣州 | 22:53 |
| D3013 | 汉口 | 07:48 | 南京南 | 11:00 | 丹阳 | 11:39 | 上海虹桥 | 13:16 |
| D3016 | 汉口 | 07:48 | 南京南 | 11:00 | 丹阳 | 11:39 | 上海虹桥 | 13:16 |
| D3009 | 汉口 | 08:35 | 南京南 | 11:46 | 丹阳 | 12:23 | 上海虹桥 | 13:54 |
| D3012 | 汉口 | 08:35 | 南京南 | 11:46 | 丹阳 | 12:23 | 上海虹桥 | 13:54 |
| D3005 | 宜昌东 | 06:43 | 南京南 | 12:46 | 丹阳 | 13:33 | 上海虹桥 | 15:15 |
| D3008 | 宜昌东 | 06:43 | 南京南 | 12:46 | 丹阳 | 13:33 | 上海虹桥 | 15:15 |
| D3041 | 武汉 | 10:15 | 南京南 | 13:23 | 丹阳 | 14:10 | 上海虹桥 | 16:00 |
| D3044 | 武汉 | 10:15 | 南京南 | 13:23 | 丹阳 | 14:10 | 上海虹桥 | 16:00 |
| D3071 | 重庆北 | 06:21 | 南京南 | 16:16 | 丹阳 | 16:53 | 上海虹桥 | 18:25 |
| D3074 | 重庆北 | 06:21 | 南京南 | 16:16 | 丹阳 | 16:53 | 上海虹桥 | 18:25 |
| D5661 | 南京 | 18:22 | 南京 | 18:22 | 丹阳 | 18:53 | 上海虹桥 | 20:27 |
| D3055 | 成都东 | 06:12 | 南京南 | 18:57 | 丹阳 | 19:42 | 上海 | 21:18 |
| D3058 | 成都东 | 06:12 | 南京南 | 18:57 | 丹阳 | 19:42 | 上海 | 21:18 |
| D3021 | 汉口 | 16:04 | 南京南 | 19:19 | 丹阳 | 19:56 | 上海虹桥 | 21:24 |
| D3024 | 汉口 | 16:04 | 南京南 | 19:19 | 丹阳 | 19:56 | 上海虹桥 | 21:24 |
| D3059 | 汉口 | 16:20 | 南京南 | 19:30 | 丹阳 | 20:13 | 嘉兴南 | 22:45 |
| D3062 | 汉口 | 16:20 | 南京南 | 19:30 | 丹阳 | 20:13 | 嘉兴南 | 22:45 |
| D635 | 成都东 | 07:10 | 南京南 | 19:56 | 丹阳 | 20:40 | 上海虹桥 | 22:15 |
| D638 | 成都东 | 07:10 | 南京南 | 19:56 | 丹阳 | 20:40 | 上海虹桥 | 22:15 |
| D351 | 成都东 | 07:52 | 南京南 | 20:01 | 丹阳 | 20:53 | 上海虹桥 | 22:21 |
| D354 | 成都东 | 07:52 | 南京南 | 20:01 | 丹阳 | 20:53 | 上海虹桥 | 22:21 |