| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3238 | 南京南 | 06:11 | 南京南 | 06:11 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D3239 | 南京南 | 06:11 | 南京南 | 06:11 | 厦门北 | 16:40 | 厦门北 | 16:40 |
| D2281 | 南京南 | 06:32 | 南京南 | 06:32 | 厦门北 | 16:56 | 深圳北 | 20:11 |
| G1667 | 南京南 | 07:02 | 南京南 | 07:02 | 厦门北 | 14:00 | 厦门北 | 14:00 |
| D3295 | 南京南 | 07:49 | 南京南 | 07:49 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D3298 | 南京南 | 07:49 | 南京南 | 07:49 | 厦门北 | 16:34 | 武平 | 18:28 |
| D3135 | 南京南 | 08:03 | 南京南 | 08:03 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| D3138 | 南京南 | 08:03 | 南京南 | 08:03 | 厦门北 | 19:01 | 赣州 | 22:53 |
| G1661 | 蚌埠南 | 07:30 | 南京南 | 08:32 | 厦门北 | 15:23 | 龙岩 | 16:30 |
| G1664 | 蚌埠南 | 07:30 | 南京南 | 08:32 | 厦门北 | 15:23 | 龙岩 | 16:30 |
| D2293 | 南京南 | 10:57 | 南京南 | 10:57 | 厦门北 | 19:20 | 深圳北 | 22:35 |
| D3141 | 南京南 | 11:12 | 南京南 | 11:12 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| D3144 | 南京南 | 11:12 | 南京南 | 11:12 | 厦门北 | 21:07 | 龙岩 | 22:13 |
| G1675 | 南京南 | 13:38 | 南京南 | 13:38 | 厦门北 | 20:32 | 厦门 | 21:01 |
| G1675 | 南京南 | 13:38 | 南京南 | 13:38 | 厦门 | 21:01 | 厦门 | 21:01 |
| G2379 | 张家港 | 13:49 | 南京南 | 15:06 | 厦门北 | 23:16 | 厦门北 | 23:16 |