0岁的时候以模特为开端，在小学低年级作为儿童角色演出舞台剧和电视。

10岁的时候获得『悲惨世界』中ガブローシュ的角色，这是他在舞台剧中初次登台。

17岁在富士TV电视剧『同一屋檐下』演出脚有缺陷的4子•文也的角色而扬名全国。

21岁时的音乐剧演出『RENT』，其准主角的表演博得好评。之后以这个角色为基础，作为跳舞•唱歌•表演于一身并有着今后在音乐界发展的才能的三栖青年演员而在艺能界引起注目。他尤其擅长四三拍节奏的音乐，是著名剧团“第三舞台”主席鸿上尚史的御用演员。

此外还曾为《花样男子》、《明日的娜嘉》等多部动画担任声优。

2004年在大河剧《新选组！》中演绎了划时代的角色土方岁三而获得包括43届日剧学院奖助演男优赏在内的六项大奖，并被任命为会津亲善大使。

山本耕史曾主持NHK综艺节目「新・真夜中の王国」，2006年12月31日出任第56回红白歌合战主持。