艾丽丝（米拉·乔沃维奇饰）从第一集的生化丧尸中逃离，可是她却依然逃不出生化危机的恶梦，万恶的保护伞公司将马特抓去完成“复仇女神”计划。经过保护伞公司地下生化实验室的改造，她被赋予了超人的力量速度和感知能力，由此爱丽丝得到了强大的力量、速度，和超能力，现在她必须担负起保护人类的工作，继续和丧尸的战斗。

生化病毒仍然在拉科恩城内肆虐蔓延，那些感染病毒的丧尸也成为威胁整个人类的因素，必须在它们更加强大之前找到病毒的来源和有效控制它的方法，以解决整个人类陷入基因突变的绝境。为了这个目的，同时也是为了找出和拯救拉科恩城内可能幸存的同胞，艾丽丝和刚刚遭到降职处分的特种防卫队队员吉尔（西娜·吉罗瑞饰）、以及佩顿（雷萨克·艾多提饰）、L.J.（迈克·埃普斯饰）、尼克莱（萨克·华德饰）以及队长卡洛斯（奥迪德·弗尔饰）组成调查组，再一次深入到拉科恩城腹地。

除了面对丧尸大军、变种怪物，他们遇到了更加强大的敌人，这个被称为“复仇邪神Nemesis”的怪物（马休·泰勒饰）是第一集中受伤的麦特在接受保护伞公司的“耐密斯计划”之后变异而成，它被输入了毁灭一切生物的指令，并且它还拥有强大的电磁炮和火箭弹拥有惊人的破坏力。